O Mestrado Acadêmico em Ciência da Computação (MACC) nível 4, foi aprovado pela CAPES e conta atualmente com 12 doutores em tempo integral. O Programa conta com apoio da Fundação Cearense de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico (Funcap) e da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES), através do Programa de Demanda Social (DS), com bolsas para os alunos com dedicação exclusiva melhor classificados no processo de seleção.

Os alunos do MACC contam com três salas de aula e um mini-auditório equipados com quadro branco e telas de projeção, e ainda com um Laboratório de Pós-graduação (LABPOS) de uso exclusivo para estudo e pesquisa, que disponibiliza mais de uma centena de computadores e notebooks,  e também bancadas livres para uso de laptops pessoais.

Os alunos podem também desenvolver suas pesquisas nos sete laboratórios temáticos presentes, que compreendem as áreas de Redes e Segurança (LARCES e LADESC), Padrões e Qualidade de Software (LAPAQ), Otimização (LOGIN), Computação Natural e Inteligente (LACONI), Laboratório de Educação à Distância para Pessoas com Deficiência (LE@D) e Matemática Computacional (LAMAC). Além da rede cabeada em todos os computadores, estão disponibilizadas áreas de acesso a redes sem fio, o que permite uma maior mobilidade aos alunos e professores.