Um dos empecilhos que a ciência encontra no ensino é sua metodologia repleta de termos. Durante a atual Pandemia os professores foram desafiados a buscarem por alternativas metodológicas que despertem nos educandos o interesse pelos conteúdos abordados durante o Ensino Remoto Emergencial. As sequências didáticas investigativas, cujo método visa proporcionar circunstâncias para que os alunos possam aduzir seus conhecimentos espontâneos e reestrutura-los em conhecimentos científicos se apresenta como um hábil recurso para superar essas barreiras. Desse modo, esse trabalho tem como objetivo relatar a vivência e as reflexões de dois residentes durante o desenvolvimento da sequência "Pandemias e História da Vacinação". A sequência foi realizada em uma turma de 1° ano do Ensino Médio de uma escola do município de Maringá/PR. Os alunos mostraram-se interessados, interagiram e responderam às questões propostas, construindo de modo significativo o conhecimento e evidenciando a contribuição do Ensino de Ciências por Investigação para o aprendizado.